恶苗病从水稻苗期至抽穗期均会发生，以分蘖期发生最多，种子带菌是主要的侵染源，然后是病稻草。播种带菌稻种或用有病的稻草覆盖，当稻种萌发时，病菌从芽鞘侵入引起发病。虽然恶苗病能引起再侵染，但病菌主要在前期即水稻芽鞘期侵入，以后侵染健康植株引起稻···